目前已知的北美的原住民是印第安人，而就在墨西哥境内曾在很早前出现过玛雅文明，玛雅文明是公元前400年开始，而最近有科学家在墨西哥境内发现30具公元前1387年之久的遗骸，有可能是美洲大陆上最早的人类。

塔毛利帕斯州La Sepultura洞穴中位于墨西哥境内，在这里科学家挖掘出的人没骨骼，进行研究的时候发现这些骨骸可以追溯到2000多年前，对他们的DNA进行测定发现，他们曾是最早的美洲基因血统之一。